ΑΚΡΩΝΥΜΙΟ: SeaBrainOmes
ΚΩΔΙΚΟΣ ΠΡΟΤΑΣΗΣ: 3990
Η αλληλούχιση RNA ενός κυττάρου (scRNA-seq) αναδεικνύεται ως ένα χρήσιμο εργαλείο για τον συστηματικό χαρακτηρισμό των κυττάρων ενός ιστού. Προκειμένου να αξιοποιηθεί αυτή η πρωτοπόρος τεχνολογία στον τομέα της κτηνιατρικής, η πρόταση SeaBrainOmes αποσκοπεί στη μελέτη και βαθιά κατανόηση των επιπτώσεων της ιογενούς εγκεφαλοπάθειας στον εγκέφαλο του λαβρακιού, αξιοποιώντας –ομικές τεχνολογίες, όπως η scRNA-seq, η αλληλούχιση ολικού RNA και miRNA, καθώς και εργαλεία που θα αναπτυχθούν για τον χαρακτηρισμό των πληθυσμών των εγκεφαλικών κυττάρων σε καλλιέργεια. Η ιογενής εγκεφαλοπάθεια και η αμφιβληστροειδοπάθεια (VER) είναι μια καταστροφική ασθένεια που απειλεί τη βιομηχανία της ιχθυοκαλλιέργειας και ιδιαίτερα οικονομικά σημαντικά είδη, όπως το λαβράκι η τσιπούρα. Προκαλείται από τον ιό νευρικής νέκρωσης (NNV). Το ευρωπαϊκό λαβράκι (Dicentrarchus Labrax) αποτελεί ένα είδος ψαριού υψηλού εμπορικού ενδιαφέροντος για τη μεσογειακή βιομηχανία ιχθυοκαλλιέργειας με τουλάχιστον 125.772 χιλιάδες τόνους παραγωγής, αξίας 534,95 εκατομμυρίων ευρώ για την Ελλάδα. Επίσης, το λαβράκι είναι ένα ενδιαφέρον ζωικό μοντέλο δεδομένου ότι ο άτλαντας του εγκεφάλου του είναι διαθέσιμος. Η ανάλυση μεμονωμένων κυττάρων σε συνδυασμό με τον χαρακτηρισμό των πρωτογενών καλλιεργειών εγκεφαλικών κυττάρων, καθώς και η ανάλυση του ολικού μεταγραφώματος του νοσούντος εγκεφάλου θα επιτρέψουν την ταυτοποίηση των διαφορετικών πληθυσμών εγκεφαλικών κυττάρων που επηρεάζονται από μόλυνση με NNV. Επιπλέον, το λαβράκι θα χρησιμεύσει ως οργανισμός-πρότυπο για την κατανόηση του ρόλου των miRNAs στην εξέλιξη μιας νευρολογικής ασθένειας στον εγκέφαλο. Η βιοπληροφορική ανάλυση των δεδομένων που θα αποκτηθούν θα εμπλουτίσει τις βασικές γνώσεις της επιστημονικής κοινότητας για τη φυσιολογία των ψαριών, θα αποκαλύψει μοριακές οδούς και θα υποδείξει την πρόοδο της νευρικής νόσου. Τέλος, τα αναμενόμενα αποτελέσματα θα αποτελέσουν την αφετηρία για μελλοντικές μελέτες σχετικά με την ιογενή εγκεφαλοπάθεια, η οποία θα βοηθήσει στην κατανόηση της παθογένεσης της νόσου και θα αναδείξει νέους στόχους φαρμάκων ή εμβολίων και μη επεμβατικούς βιοδείκτες για την διάγνωσή της, αποτρέποντας απώλειες υψηλού οικονομικού και περιβαλλοντικού κόστους.
